ФЭНДОМ


   LOCUS       NC_009708            4723306 bp    DNA     circular BCT 19-SEP-2007
   DEFINITION  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758, complete genome.
   ACCESSION   NC_009708
   VERSION     NC_009708.1  GI:153946813
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Yersinia pseudotuberculosis IP 31758
     ORGANISM  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
               Enterobacteriaceae; Yersinia.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4723306)
     AUTHORS   Eppinger,M., Rosovitz,M.J., Fricke,W.F., Rasko,D.A., Kokorina,G.,
               Fayolle,C., Lindler,L.E., Carniel,E. and Ravel,J.
     TITLE     The complete genome sequence of Yersinia pseudotuberculosis
               IP31758, the causative agent of Far East scarlet-like fever
     JOURNAL   PLoS Genet. 3 (8), E142 (2007)
      PUBMED   17784789
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4723306)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (26-JUL-2007) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4723306)
     AUTHORS   Eppinger,M., Rosovitz,M., Fricke,W.W., Rasko,D.A., Lindler,L.E.,
               Carniel,E. and Ravel,J.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (05-JUN-2007) Microbial Genomics and Pathogen Functional
               Genomic Resource Center, J. Craig Venter Institute, 9712 Medical
               Center Drive, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000720.
               Inquiries for DNA can be made to Elizabeth Carniel
               (carniel2@pasteur.fr).
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК Править

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
12000 13542 + 1543 153946813 YpsIP31758_4189 - 16S ribosomal RNA
13678 13755 + 78 153946813 YpsIP31758_4190 - 04</sub> Glu tRNA
14007 16913 + 2907 153946813 YpsIP31758_4191 - 23S ribosomal RNA
17021 17140 + 120 153946813 YpsIP31758_4192 - 5S ribosomal RNA
25613 25730 + 118 153946813 YpsIP31758_4297 - Spot 42 RNA
26868 27121 + 254 153946813 YpsIP31758_4298 - CsrC RNA family
159777 161319 + 1543 153946813 YpsIP31758_4193 - 16S ribosomal RNA
161455 161532 + 78 153946813 YpsIP31758_4194 - 04</sub> Glu tRNA
161784 164690 + 2907 153946813 YpsIP31758_4195 - 23S ribosomal RNA
164798 164917 + 120 153946813 YpsIP31758_4196 - 5S ribosomal RNA
165040 165118 + 79 153946813 YpsIP31758_4197 - 06</sub> Asp tRNA
165125 165202 + 78 153946813 YpsIP31758_4198 - 20</sub> Trp tRNA
221179 221255 + 77 153946813 YpsIP31758_4199 - 11</sub> Arg tRNA
221338 221415 + 78 153946813 YpsIP31758_4200 - 09</sub> His tRNA
221430 221518 + 89 153946813 YpsIP31758_4201 - 15</sub> Leu tRNA
221592 221670 + 79 153946813 YpsIP31758_4202 - 03</sub> Pro tRNA
322792 324334 + 1543 153946813 YpsIP31758_4203 - 16S ribosomal RNA
324436 324514 + 79 153946813 YpsIP31758_4204 - 14</sub> Ile tRNA
324564 324641 + 78 153946813 YpsIP31758_4205 - 02</sub> Ala tRNA
324859 327765 + 2907 153946813 YpsIP31758_4206 - 23S ribosomal RNA
327875 327990 + 116 153946813 YpsIP31758_4300 - 5S ribosomal RNA
328005 328082 + 78 153946813 YpsIP31758_4207 - 12</sub> Thr tRNA
328120 328239 + 120 153946813 YpsIP31758_4208 - 5S ribosomal RNA
547912 548024 - 113 153946813 YpsIP31758_4301 - SraH RNA
554644 554946 + 303 153946813 YpsIP31758_4302 - RNase P class A
649301 649379 - 79 153946813 YpsIP31758_4209 - 16</sub> Met tRNA
977582 977659 - 78 153946813 YpsIP31758_4210 - 17</sub> Phe tRNA
1037218 1037399 - 182 153946813 YpsIP31758_4304 - 6S / SsrS RNA
1068026 1068099 + 74 153946813 YpsIP31758_4211 - 01</sub> Gly tRNA
1165923 1166017 + 95 153946813 YpsIP31758_4305 - sraE/rygA/rygB family RNA
1195603 1195679 - 77 153946813 YpsIP31758_4212 - 16</sub> Met tRNA
1195740 1195816 - 77 153946813 YpsIP31758_4213 - 16</sub> Met tRNA
1195984 1196060 - 77 153946813 YpsIP31758_4214 - 16</sub> Met tRNA
1200711 1200817 - 107 153946813 YpsIP31758_4306 - gcvB RNA
1208063 1208385 + 323 153946813 YpsIP31758_4307 - CsrB/RsmB RNA family
1215459 1215665 + 207 153946813 YpsIP31758_4308 - t44 RNA
1247810 1249364 + 1555 153946813 YpsIP31758_4215 - 16S ribosomal RNA
1249488 1249565 + 78 153946813 YpsIP31758_4216 - 04</sub> Glu tRNA
1249817 1252723 + 2907 153946813 YpsIP31758_4217 - 23S ribosomal RNA
1252831 1252950 + 120 153946813 YpsIP31758_4218 - 5S ribosomal RNA
1253073 1253151 + 79 153946813 YpsIP31758_4219 - 06</sub> Asp tRNA
1260509 1260587 + 79 153946813 YpsIP31758_4220 - 06</sub> Asp tRNA
1353391 1353555 - 165 153946813 YpsIP31758_4309 - tke1 RNA
1418759 1418844 - 86 153946813 YpsIP31758_4311 - RyeE RNA
1550997 1551074 - 78 153946813 YpsIP31758_4221 - 02</sub> Ala tRNA
1551150 1551227 - 78 153946813 YpsIP31758_4222 - 02</sub> Ala tRNA
1553148 1553223 + 76 153946813 YpsIP31758_4223 - 13</sub> Val tRNA
1553260 1553335 + 76 153946813 YpsIP31758_4224 - 13</sub> Val tRNA
1553379 1553456 + 78 153946813 YpsIP31758_4225 - 13</sub> Val tRNA
1553654 1553731 + 78 153946813 YpsIP31758_4226 - 10</sub> Lys tRNA
1622954 1623028 + 75 153946813 YpsIP31758_4227 - 11</sub> Arg tRNA
2008789 2008897 - 109 153946813 YpsIP31758_4312 - rprA RNA
2025240 2025318 - 79 153946813 YpsIP31758_4228 - 13</sub> Val tRNA
2025467 2025545 - 79 153946813 YpsIP31758_4229 - 13</sub> Val tRNA
2025603 2025681 - 79 153946813 YpsIP31758_4230 - 13</sub> Val tRNA
2063571 2063671 + 101 153946813 YpsIP31758_4313 - RyhB RNA
2275524 2275610 + 87 153946813 YpsIP31758_4231 - 18</sub> Tyr tRNA
2275674 2275760 + 87 153946813 YpsIP31758_4232 - 18</sub> Tyr tRNA
2366861 2366952 + 92 153946813 YpsIP31758_4233 - 08</sub> Ser tRNA
2374510 2374601 + 92 153946813 YpsIP31758_4234 - 08</sub> Ser tRNA
2494338 2494415 + 78 153946813 YpsIP31758_4235 - 07</sub> Asn tRNA
2557109 2557194 - 86 153946813 YpsIP31758_4236 - 15</sub> Leu tRNA
2557204 2557279 - 76 153946813 YpsIP31758_4237 - 19</sub> Cys tRNA
2557331 2557406 - 76 153946813 YpsIP31758_4238 - 01</sub> Gly tRNA
2563856 2563933 - 78 153946813 YpsIP31758_4239 - 10</sub> Lys tRNA
2639150 2639399 + 250 153946813 YpsIP31758_4314 - sraC/ryeA RNA
2639187 2639288 - 102 153946813 YpsIP31758_4315 - RyeB RNA
2693239 2693316 + 78 153946813 YpsIP31758_4240 - 07</sub> Asn tRNA
2704257 2704334 + 78 153946813 YpsIP31758_4241 - 07</sub> Asn tRNA
2861232 2861321 - 90 153946813 YpsIP31758_4242 - 08</sub> Ser tRNA
2873877 2873946 + 70 153946813 YpsIP31758_4316 - RNA-OUT
3004582 3004662 + 81 153946813 YpsIP31758_4317 - rybB RNA
3079302 3079380 + 79 153946813 YpsIP31758_4243 - 03</sub> Pro tRNA
3111104 3111179 - 76 153946813 YpsIP31758_4244 - 12</sub> Thr tRNA
3111184 3111273 - 90 153946813 YpsIP31758_4245 - 08</sub> Ser tRNA
3114232 3114318 + 87 153946813 YpsIP31758_4318 - micF RNA
3235183 3235253 - 71 153946813 YpsIP31758_4246 -
3235350 3235420 - 71 153946813 YpsIP31758_4247 - 10</sub> Lys tRNA
3235517 3235587 - 71 153946813 YpsIP31758_4248 - 10</sub> Lys tRNA
3235684 3235754 - 71 153946813 YpsIP31758_4249 -
3235782 3235857 - 76 153946813 YpsIP31758_4250 - 10</sub> Lys tRNA
3235885 3235960 - 76 153946813 YpsIP31758_4251 - 10</sub> Lys tRNA
3235988 3236063 - 76 153946813 YpsIP31758_4252 - 10</sub> Lys tRNA
3236090 3236167 - 78 153946813 YpsIP31758_4253 - 10</sub> Lys tRNA
3263983 3264346 + 364 153946813 YpsIP31758_4254 - 10Sa RNA (tmRNA)
3286365 3286443 + 79 153946813 YpsIP31758_4255 - 16</sub> Met tRNA
3286449 3286535 + 87 153946813 YpsIP31758_4256 - 15</sub> Leu tRNA
3286564 3286638 + 75 153946813 YpsIP31758_4257 - 05</sub> Gln tRNA
3286721 3286797 + 77 153946813 YpsIP31758_4258 - 05</sub> Gln tRNA
3286828 3286906 + 79 153946813 YpsIP31758_4259 - 16</sub> Met tRNA
3286910 3286986 + 77 153946813 YpsIP31758_4260 - 05</sub> Gln tRNA
3391250 3391328 - 79 153946813 YpsIP31758_4261 - 11</sub> Arg tRNA
3409729 3409812 - 84 153946813 YpsIP31758_4321 - sroB RNA
3460689 3460788 - 100 153946813 YpsIP31758_4322 - bacterial signal recognition particle RNA
3612672 3612791 - 120 153946813 YpsIP31758_4262 - 5S ribosomal RNA
3612899 3615805 - 2907 153946813 YpsIP31758_4263 - 23S ribosomal RNA
3616023 3616100 - 78 153946813 YpsIP31758_4264 - 02</sub> Ala tRNA
3616150 3616228 - 79 153946813 YpsIP31758_4265 - 14</sub> Ile tRNA
3616318 3617872 - 1555 153946813 YpsIP31758_4266 - 16S ribosomal RNA
3639626 3639700 + 75 153946813 YpsIP31758_4323 - sraD RNA
3642656 3642727 - 72 153946813 YpsIP31758_4267 -
3642806 3642884 - 79 153946813 YpsIP31758_4268 - 11</sub> Arg tRNA
3642962 3643040 - 79 153946813 YpsIP31758_4269 - 11</sub> Arg tRNA
3643096 3643174 - 79 153946813 YpsIP31758_4270 - 11</sub> Arg tRNA
3643181 3643275 - 95 153946813 YpsIP31758_4271 - 08</sub> Ser tRNA
3958156 3958242 + 87 153946813 YpsIP31758_4272 - 15</sub> Leu tRNA
3958338 3958426 + 89 153946813 YpsIP31758_4273 - 15</sub> Leu tRNA
3958539 3958625 + 87 153946813 YpsIP31758_4274 - 15</sub> Leu tRNA
4000577 4000663 - 87 153946813 YpsIP31758_4275 - 15</sub> Leu tRNA
4057624 4057805 + 182 153946813 YpsIP31758_4325 - SraG RNA
4058035 4058153 - 119 153946813 YpsIP31758_4326 - Ribosomal S15 leader
4064543 4064619 - 77 153946813 YpsIP31758_4276 - 16</sub> Met tRNA
4064679 4064767 - 89 153946813 YpsIP31758_4277 - 15</sub> Leu tRNA
4126771 4126846 - 76 153946813 YpsIP31758_4278 - 01</sub> Gly tRNA
4126914 4126989 - 76 153946813 YpsIP31758_4279 - 01</sub> Gly tRNA
4127080 4127157 - 78 153946813 YpsIP31758_4280 - 01</sub> Gly tRNA
4157183 4157260 + 78 153946813 YpsIP31758_4281 - 17</sub> Phe tRNA
4323713 4323832 - 120 153946813 YpsIP31758_4282 - 5S ribosomal RNA
4323940 4326846 - 2907 153946813 YpsIP31758_4283 - 23S ribosomal RNA
4327097 4327174 - 78 153946813 YpsIP31758_4284 - 04</sub> Glu tRNA
4327298 4328852 - 1555 153946813 YpsIP31758_4285 - 16S ribosomal RNA
4359497 4359574 - 78 153946813 YpsIP31758_4286 - 12</sub> Thr tRNA
4359580 4359654 - 75 153946813 YpsIP31758_4287 - 01</sub> Gly tRNA
4359804 4359888 - 85 153946813 YpsIP31758_4288 - 18</sub> Tyr tRNA
4359906 4359983 - 78 153946813 YpsIP31758_4289 - 12</sub> Thr tRNA
4365284 4365403 - 120 153946813 YpsIP31758_4290 - 5S ribosomal RNA
4365511 4368417 - 2907 153946813 YpsIP31758_4291 - 23S ribosomal RNA
4368635 4368712 - 78 153946813 YpsIP31758_4292 - 02</sub> Ala tRNA
4368762 4368840 - 79 153946813 YpsIP31758_4293 - 14</sub> Ile tRNA
4368930 4370484 - 1555 153946813 YpsIP31758_4294 - 16S ribosomal RNA
4530557 4530660 - 104 153946813 YpsIP31758_4329 - RyhB RNA
4597616 4597694 - 79 153946813 YpsIP31758_4295 - 03</sub> Pro tRNA
4621124 4621218 - 95 153946813 YpsIP31758_4296 - Sec tRNA

Обнаружено использование расширения AdBlock.


Викия — это свободный ресурс, который существует и развивается за счёт рекламы. Для блокирующих рекламу пользователей мы предоставляем модифицированную версию сайта.

Викия не будет доступна для последующих модификаций. Если вы желаете продолжать работать со страницей, то, пожалуйста, отключите расширение для блокировки рекламы.